Ja, die Webalizer-Statistik kann bei einem Server ausgeschaltet werden, wenn sie nicht benötigt wird.
Wenn Webmin als Admin-Frontend genutzt wird, kann im Webalizer-Modul der Verweis zur Logfile entfernt werden. Ab dann sollten keine grafischen Statistiken mehr erstellt werden.
Bitte beachten Sie aber, dass die Logfiles selbst dennoch geschrieben werden.